离子交换层析（IEC）是依据各种离子或离子化合物与离子交换填料的结合力不同而进行分离纯化的。离子交换层析的固定相是离子交换填料，它是由一类不溶于水的惰性高分子聚合物基质通过一定的化学反应共价结合上某种电荷基团形成的，是用于制造蛋白质药物最常见的技术。由于离子交换填料的动态吸附载量（DBC）相对要高于其他分离模式，许多客户选择此层析法进行捕获或浓缩样品。