聚甲基丙烯酸酯基反相柱现有各种孔径和粒径可供选择。尽管不如硅胶基质RPC柱有效和坚固，但聚合物柱也具有明显的优点，如较广的pH范围（1~12），可使多种碱性化合物在未带电形式下接受分析，因而减少第二类吸附作用并改良峰形。第二类相互作用的减少使多肽和蛋白质回收率得以提高。