聚甲基丙烯酸酯基反相柱现有各种孔径和粒径可供选择。尽管不如硅胶基质RPC柱有效和坚固，但聚合物柱也具有明显的优点，如较广的pH范围（1~12），可使多种碱性化合物在未带电形式下接受分析，因而减少第二类吸附作用并改良峰形。第二类相互作用的减少使多肽和蛋白质回收率得以提高。TSKgel Phenyl-5PW RP以粒径为10µm的G5000PW树脂为基质，孔径平均尺寸为1000Å，可以进行分子量高达1000000Da的球状蛋白的分析。色谱柱交联度非常高，增加了色谱柱对水相/有机溶剂流动相梯度的稳定性。